Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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