Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC9Q06265 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms