Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms