Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERCC6Q03468 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms