Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms