Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP153P49790 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP153P49790 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP153P49790 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP153P49790 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP153P49790 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP153P49790 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP153P49790 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP153P49790 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms