Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561P49447 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms