Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK1DP48730 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms