Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-FP30511 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms