Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms