Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXP28300 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXP28300 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LOXP28300 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LOXP28300 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LOXP28300 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LOXP28300 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LOXP28300 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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