Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTX3P26022 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTX3P26022 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms