Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms