Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DESP17661 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DESP17661 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms