Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms