Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms