Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYBBP04839 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYBBP04839 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYBBP04839 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms