Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCTN3O75935 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms