Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSVO60911 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTSVO60911 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTSVO60911 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms