Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms