Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms