Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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