Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEFF2Q9UIK5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms