Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFDP1Q9UEE9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms