Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms