Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms