Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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