Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PCDHB16Q9NRJ7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCDHB16Q9NRJ7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCDHB16Q9NRJ7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCDHB16Q9NRJ7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PCDHB16Q9NRJ7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PCDHB16Q9NRJ7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PCDHB16Q9NRJ7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PCDHB16Q9NRJ7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCDHB16Q9NRJ7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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