Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms