Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms