Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLMPQ9H6B4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLMPQ9H6B4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms