Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00597Q9H2U6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms