Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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