Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM4Q9C037 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms