Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms