Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 Z84468.1-202ENST00000630584 667 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX25-202ENST00000525943 1646 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-DOB-206ENST00000438763 1372 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MBIP-202ENST00000359527 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf32-202ENST00000624458 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 GOSR2-219ENST00000638697 1705 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MED6-202ENST00000430055 1507 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2AJ1-201ENST00000318244 1873 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRNP40-202ENST00000373720 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP218-201ENST00000410222 292 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL35P5-201ENST00000433398 370 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6AP1L-202ENST00000439350 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 UGT1A11P-201ENST00000456635 849 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX2-OT-212ENST00000491282 882 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1K-204ENST00000508256 923 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 NIFKP2-201ENST00000513462 856 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 IL18-202ENST00000524595 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023078.3-201ENST00000527463 958 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02295-201ENST00000557072 374 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 ANP32AP1-201ENST00000559548 737 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB11A-204ENST00000565075 711 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MED31-203ENST00000575197 593 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms