Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms