Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1Q99684 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GFI1Q99684 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GFI1Q99684 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1Q99684 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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