Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms