Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms