Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms