Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHMTQ93088 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms