Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3S1Q92572 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3S1Q92572 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S1Q92572 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S1Q92572 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms