Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCSTNQ92542 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms