Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms