Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms