Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf43Q8TAL5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms