Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF148Q8N7C7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms