Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms