Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2R9

SSBP3-AS1, Putative uncharacterized protein SSBP3-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms